El museo posee diferentes Manuales de Observación: publicaciones hechas para colecciones específicas y que, dirigidas a niños y niñas, explican de manera simple cada obra.
Los manuales Rugendas y Lira y Arte Colonial fueron hechos gracias al financiamiento del Consejo Nacional de la Cultura y las Artes, a través del Fondo de Fomento al Arte en la Educación.